FTP로 불러온 파일을 원격 서버로 저장하려면 Alt+Shift+Q를 누르면 됩니다.

단순히 Ctrl+S를 누르면 업로드가 되지 않습니다.

단축키를 변경하는 방법은,

Settings | Keymap | Upload current remote file 를 찾으셔서 해당 항목에 마우스 우측 버튼을 클릭 후,

Add Keyboard Shortcut 에서 입력하시고 저장해서 사용하시면 됩니다.

저는 Ctrl+Shift+Q를 입력해서 사용합니다.